Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trabd2bB1ATG9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trabd2bB1ATG9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trabd2bB1ATG9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trabd2bB1ATG9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms