Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Spocd1B1ASB6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Spocd1B1ASB6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms