Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik3B1AS29 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms