Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms