Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl41A2AUC9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl41A2AUC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms