Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga8A2ARA8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga8A2ARA8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms