Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rtf1A2AQ19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rtf1A2AQ19 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Rtf1A2AQ19 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rtf1A2AQ19 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms