Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW4

Ppp1r3d, Protein phosphatase 1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3dA2AJW4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppp1r3dA2AJW4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppp1r3dA2AJW4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms