Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sdccag3A2AIW0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sdccag3A2AIW0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sdccag3A2AIW0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sdccag3A2AIW0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Sdccag3A2AIW0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdccag3A2AIW0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdccag3A2AIW0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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