Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930447F04RikA2AFR2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms