Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm16A2A935 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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