Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prdm2A2A7B5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prdm2A2A7B5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms