Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4921501E09RikA0A0R4J054 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms