Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms