Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv5A0A0B4J1G9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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