Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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