Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
B020011L13RikA0A087WQI7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms