Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
PRPF4BQ13523 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PRPF4BQ13523 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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