Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
GRIK2Q13002 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
GRIK2Q13002 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms