Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
DDX39BQ13838 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
DDX39BQ13838 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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