Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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TRAF1Q13077 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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