Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK2Q13002 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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