Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-BlV9GXR0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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H2-BlV9GXR0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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H2-BlV9GXR0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-BlV9GXR0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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H2-BlV9GXR0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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H2-BlV9GXR0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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