Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm3839S4R1W1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm3839S4R1W1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm3839S4R1W1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3839S4R1W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm3839S4R1W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3839S4R1W1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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