Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Homer1Q9Z2Y3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms