Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcniQ9Z2V9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms