Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krt16Q9Z2K1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt16Q9Z2K1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms