Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd1Q9Z2E2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd1Q9Z2E2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms