Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Upk1bQ9Z2C6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms