Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms