Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sfrp4Q9Z1N6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms