Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf1Q9Z1B8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms