Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Setbp1Q9Z180 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Setbp1Q9Z180 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms