Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shcbp1Q9Z179 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms