Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sumo3Q9Z172 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sumo3Q9Z172 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms