Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dctn3Q9Z0Y1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn3Q9Z0Y1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms