Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gipc1Q9Z0G0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gipc1Q9Z0G0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms