Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cib1Q9Z0F4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cib1Q9Z0F4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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