Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms