Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfsf13bQ9WU72 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms