Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scnn1bQ9WU38 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms