Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PplQ9R269 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PplQ9R269 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms