Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TapbpQ9R233 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TapbpQ9R233 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TapbpQ9R233 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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