Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim3Q9R1R2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim3Q9R1R2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms