Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tubd1Q9R1K7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubd1Q9R1K7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms