Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slit2Q9R1B9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slit2Q9R1B9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms