Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zeb2Q9R0G7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zeb2Q9R0G7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms