Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod3Q9R0E1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod3Q9R0E1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms