Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Wdr54Q9R0D8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Wdr54Q9R0D8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms