Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plod2Q9R0B9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Plod2Q9R0B9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms